区境交通，向以水路为主。黄浦江穿越区境东南部，北出吴淞口。两岸支流多，航运便利。上海开埠后，外商纷纷占用岸线，辟建码头。至本世纪初，区境沿江滩地已成为上海港码头基地之一。

　　解放后，这些码头先后收归国有，经过归并、调整和对设备的改进，已分别发展成现代化的装卸公司。改革开放以来，货运日趋繁忙，1990年吞吐量达1965万吨。区境无对外水路客运航线，仅有6条对江轮渡线，沟通两岸往来。内河航运，清末通航河道有百余条，现仅存10余条。这些河道，除黄浦江南岸3条支流和复兴岛运河可通航外，其余支流基本上只起排水作用。